Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

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Length 140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TRAPPC2LQ9UL33 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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