Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 THY1-209ENST00000580275 578 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 RHBDD2-203ENST00000428119 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CC2D2AQ9P2K1 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CC2D2AQ9P2K1 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms