Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CNIH4Q9P003 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
CNIH4Q9P003 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms