Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TMEM30AQ9NV96 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms