Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPF2

CHST11, Carbohydrate sulfotransferase 11, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST11Q9NPF2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHST11Q9NPF2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHST11Q9NPF2 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHST11Q9NPF2 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHST11Q9NPF2 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHST11Q9NPF2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CHST11Q9NPF2 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
CHST11Q9NPF2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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