Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ELL3Q9HB65 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ELL3Q9HB65 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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