Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SCAPERQ9BY12 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCAPERQ9BY12 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms