Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 IZUMO1R-202ENST00000440961 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SLC25A21-203ENST00000555449 1023 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 EXOSC5-204ENST00000596905 826 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MIR5196-201ENST00000578146 115 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SGIP1Q9BQI5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SGIP1Q9BQI5 HKR1-225ENST00000592168 566 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms