Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD8

SENP8, Sentrin-specific protease 8, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP8Q96LD8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SENP8Q96LD8 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms