Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CAMK2A-201ENST00000348628 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DLGAP2-214ENST00000612087 10088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC9.02□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KIAA0319-205ENST00000543707 5314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC113189.2-201ENST00000575310 1975 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PTPRK-207ENST00000368226 6087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DYSF-203ENST00000409366 6606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DYSF-205ENST00000409651 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC006001.3-201ENST00000449307 7092 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FGFR1-211ENST00000425967 5375 ntTSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 MYH3-205ENST00000583535 6037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.01□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 POU5F2-201ENST00000606183 8418 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 CACUL1-201ENST00000369151 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
LINC00208Q96KT6 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms