Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
L3HYPDHQ96EM0 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms