Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SIRT1Q96EB6 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SIRT1Q96EB6 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms