Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NEDD1Q8NHV4 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms