Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC010618.2-201ENST00000596192 460 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC018695.4-201ENST00000602706 689 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TREML4Q6UXN2 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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TREML4Q6UXN2 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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TREML4Q6UXN2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
TREML4Q6UXN2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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