Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ZBED9Q6R2W3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZBED9Q6R2W3 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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