Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CCDC174Q6PII3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms