Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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RPE65Q16518 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RPE65Q16518 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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