Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CCDC6Q16204 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CCDC6Q16204 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
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