Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
PDCD1Q15116 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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