Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GAPVD1Q14C86 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GAPVD1Q14C86 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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