Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
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CHD4Q14839 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PIN4P1-201ENST00000451079 396 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CHD4Q14839 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
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