Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CUL4AQ13619 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms