Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PTGDRQ13258 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.9 ms