Protein–RNA interactions for Protein: Q12894

IFRD2, Interferon-related developmental regulator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD2Q12894 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
IFRD2Q12894 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFRD2Q12894 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFRD2Q12894 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFRD2Q12894 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFRD2Q12894 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFRD2Q12894 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFRD2Q12894 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFRD2Q12894 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
IFRD2Q12894 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms