Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SLC18A2Q05940 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A2Q05940 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A2Q05940 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A2Q05940 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A2Q05940 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
SLC18A2Q05940 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms