Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RELAQ04206 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms