Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SKOR1P84550 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms