Protein–RNA interactions for Protein: P48645

NMU, Neuromedin-U, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMUP48645 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 CACNA1G-222ENST00000510366 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 CACNA1G-227ENST00000513964 6735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 AHI1-201ENST00000265602 4335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 EEF2K-201ENST00000263026 7388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 TECTA-201ENST00000264037 6468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 SNED1-201ENST00000310397 8174 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 NRXN1-210ENST00000406316 9375 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
NMUP48645 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 CDK12-201ENST00000430627 5918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 WDR73-202ENST00000434634 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 NSD2-206ENST00000382895 7827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 EIF3A-201ENST00000369144 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 GBF1-201ENST00000369983 6403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
NMUP48645 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
NMUP48645 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.59
NMUP48645 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms