Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GJA8P48165 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 RN7SL736P-201ENST00000613111 269 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GJA8P48165 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
GJA8P48165 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
GJA8P48165 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms