Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPOP42166 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPOP42166 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPOP42166 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPOP42166 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TMPOP42166 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TMPOP42166 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPOP42166 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TMPOP42166 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms