Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PPARGP37231 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PPARGP37231 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms