Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR7P32248 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR7P32248 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR7P32248 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR7P32248 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR7P32248 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CCR7P32248 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CCR7P32248 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms