Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
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CASQ1P31415 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CASQ1P31415 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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