Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
TSPOP30536 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms