Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LMO2P25791 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LMO2P25791 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms