Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ADAMTSL1-205ENST00000380548 8030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 SCN2B-201ENST00000278947 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
GCSHP23434 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TRAF3-208ENST00000560371 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
GCSHP23434 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms