Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
EFNA1P20827 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
EFNA1P20827 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms