Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CALM2P0DP24 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CALM2P0DP24 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms