Protein–RNA interactions for Protein: P07949

RET, Proto-oncogene tyrosine-protein kinase receptor Ret, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETP07949 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RETP07949 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RETP07949 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RETP07949 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RETP07949 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RETP07949 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RETP07949 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RETP07949 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RETP07949 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RETP07949 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RETP07949 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RETP07949 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
RETP07949 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RETP07949 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RETP07949 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RETP07949 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms