Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VAPBO95292 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPBO95292 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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VAPBO95292 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VAPBO95292 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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