Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

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Length 518 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ATE1O95260 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ATE1O95260 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ATE1O95260 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ATE1O95260 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
ATE1O95260 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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ATE1O95260 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
ATE1O95260 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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