Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
DCTN3O75935 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms