Protein–RNA interactions for Protein: O43760

SYNGR2, Synaptogyrin-2, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR2O43760 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
SYNGR2O43760 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms