Protein–RNA interactions for Protein: O43541

SMAD6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD6O43541 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMAD6O43541 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms