Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 DNM1P41-201ENST00000623634 3350 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 LINC01749-202ENST00000607802 3408 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLGNO14967 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLGNO14967 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLGNO14967 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLGNO14967 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms