Protein–RNA interactions for Protein: A8MV65

VGLL3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL3A8MV65 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 VAV1-207ENST00000599806 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CADM1-206ENST00000537058 3550 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 ATXN2L-201ENST00000325215 3788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 TOX2-203ENST00000372999 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VGLL3A8MV65 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CST3-203ENST00000398411 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TMEM199-201ENST00000292114 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RIC8A-203ENST00000526104 3703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SEC23A-201ENST00000307712 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SLC25A25-204ENST00000373069 3376 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TBX3-202ENST00000349155 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ADAMTSL2-202ENST00000393060 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 RIPK4-201ENST00000332512 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
VGLL3A8MV65 NFKB1-202ENST00000394820 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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