Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SNX13Q9Y5W8 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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SNX13Q9Y5W8 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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SNX13Q9Y5W8 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SNX13Q9Y5W8 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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