Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TNPO3Q9Y5L0 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms