Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CTNNA3Q9UI47 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms