Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
COMMD8Q9NX08 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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